W oparciu o walory przyrodnicze, zachodzące procesy oraz aktualny stan zachowania, wyróżniono strefy funkcjonalne wraz z przyporządkowanymi działaniami ochronnymi w zakresie zadań szczegółowych. Najcenniejsze powierzchnie roślinności nieleśnej podlegają ochronie ścisłej – obejmuje ona tereny zajęte przez: zbiorowiska inicjalne, murawowe i zaroślowe na klifie nadmorskim i nadzalewowym oraz zbocza Jeziora Turkusowego, enklawy muraw i zarośli w obrębie zbiorowisk