
Przeważająca większość terenu Wolińskiego Parku Narodowego, zlokalizowana jest na obszarze Natura 2000 Wolin i Uznam PLH 320019. Duży fragment Parku to Obszar Specjalnej Ochrony Ptaków – PLB 320002 Delta Świna. Oba tereny charakteryzują się bardzo dużą bioróżnorodności przyrodniczą. Specjalny obszar ochrony swoim zasięgiem obejmuje ramiona Świny wraz z położonymi między nimi wyspami , przybrzeżna strefę Zatoki Pomorskiej oraz wschodnią część wyspy Uznam wraz z Kanałem Piastowskim. Przeważającą ilość otwartych powierzchni lądowych zajmują płaty szuwaru właściwego, zbiorowiska halofilnego półszuwaru oraz cenne przyrodniczo słonawy. Typowe zbiorowiska leśne na tym obszarze to mieszane lasy bukowo-dębowe i brzozowo-dębowe, olsy oraz bory bażynowe. Istotny biologicznie element powierzchni Parku stanowią także jeziora oraz wody Zatoki Pomorskiej o szerokości 1 Mm.

